CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Multiatlas Segmentation Using Robust Feature-Based Registration

Frida Fejne (Institutionen för signaler och system, Bildanalys och datorseende) ; Matilda Landgren ; Jennifer Alvén (Institutionen för signaler och system, Bildanalys och datorseende) ; Johannes Ulén ; Johan Fredriksson ; Viktor Larsson ; Olof Enqvist (Institutionen för signaler och system, Bildanalys och datorseende) ; Fredrik Kahl (Institutionen för signaler och system, Bildanalys och datorseende)
, Cloud-Based Benchmarking of Medical Image Analysis p. 203-218. (2017)
[Kapitel]

This paper presents a pipeline which uses a multiatlas approach for multiorgan segmentation in whole-body CT images. In order to obtain accurate registrations between the target and the atlas images, we develop an adapted feature-based method which uses organ-specific features. These features are learnt during an offline preprocessing step, and thus, the algorithm still benefits from the speed of feature-based registration methods. These feature sets are then used to obtain pairwise non-rigid transformations using RANSAC followed by a thin-plate spline refinement or NiftyReg. The fusion of the transferred atlas labels is performed using a random forest classifier, and finally, the segmentation is obtained using graph cuts with a Potts model as interaction term. Our pipeline was evaluated on 20 organs in 10 whole-body CT images at the VISCERAL Anatomy Challenge, in conjunction with the International Symposium on Biomedical Imaging, Brooklyn, New York, in April 2015. It performed best on majority of the organs, with respect to the Dice index.



Den här publikationen ingår i följande styrkeområden:

Läs mer om Chalmers styrkeområden  

Denna post skapades 2017-06-01.
CPL Pubid: 249557

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för signaler och system, Bildanalys och datorseende (2013-2017)

Ämnesområden

Informations- och kommunikationsteknik
Livsvetenskaper
Bildanalys
Medicinteknik

Chalmers infrastruktur