CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Glycosaminoglycan Profiling in Patients' Plasma and Urine Predicts the Occurrence of Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma

Francesco Gatto (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi) ; N. Volpi ; H. Nilsson ; Intawat Nookaew (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi) ; M. Maruzzo ; A. Roma ; M. E. Johansson ; Ulrika Stierner ; Sven Lundstam ; U. Basso ; Jens B. Nielsen (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi)
Cell Reports (2211-1247). Vol. 15 (2016), 8, p. 1822-1836.
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

Metabolic reprogramming is a hallmark of clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) progression. Here, we used genome-scale metabolic modeling to elucidate metabolic reprogramming in 481 ccRCC samples and discovered strongly coordinated regulation of glycosaminoglycan (GAG) biosynthesis at the transcript and protein levels. Extracellular GAGs are implicated in metastasis, so we speculated that such regulation might translate into a non-invasive biomarker for metastatic ccRCC (mccRCC). We measured 18 GAG properties in 34 mccRCC samples versus 16 healthy plasma and/or urine samples. The GAG profiles were distinctively altered in mccRCC. We derived three GAG scores that distinguished mccRCC patients with 93.1%-100% accuracy. We validated the score accuracies in an independent cohort (up to 18 mccRCC versus nine healthy) and verified that the scores normalized in eight patients with no evidence of disease. In conclusion, coordinated regulation of GAG biosynthesis occurs in ccRCC, and non-invasive GAG profiling is suitable for mccRCC diagnosis.



Denna post skapades 2016-06-27. Senast ändrad 2016-07-12.
CPL Pubid: 238363

 

Läs direkt!

Lokal fulltext (fritt tillgänglig)

Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi
Institutionen för kliniska vetenskaper, sektionen för onkologi, radiofysik, radiologi och urologi, Avdelningen för onkologi (GU)
Institutionen för kliniska vetenskaper, sektionen för onkologi, radiofysik, radiologi och urologi, Avdelningen för urologi (GU)

Ämnesområden

Cellbiologi

Chalmers infrastruktur