CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Phylogenetic confidence intervals for the optimal trait value

K. Bartoszek ; Serik Sagitov (Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik)
Journal of Applied Probability (0021-9002). Vol. 52 (2015), 4, p. 1115-1132.
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

We consider a stochastic evolutionary model for a phenotype developing amongst n related species with unknown phylogeny. The unknown tree is modelled by a Yule process conditioned on n contemporary nodes. The trait value is assumed to evolve along lineages as an Ornstein-Uhlenbeck process. As a result, the trait values of the n species form a sample with dependent observations. We establish three limit theorems for the sample mean corresponding to three domains for the adaptation rate. In the case of fast adaptation, we show that for large n the normalized sample mean is approximately normally distributed. Using these limit theorems, we develop novel confidence interval formulae for the optimal trait value.

Nyckelord: Central limit theorem, conditionedYule process, macroevolution, martingales, Ornstein-Uhlenbeck process, phylogenetics



Den här publikationen ingår i följande styrkeområden:

Läs mer om Chalmers styrkeområden  

Denna post skapades 2016-02-17. Senast ändrad 2017-09-14.
CPL Pubid: 232141

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik (2005-2016)

Ämnesområden

Livsvetenskaper
Matematik

Chalmers infrastruktur

 


Projekt

Denna publikation är ett resultat av följande projekt:


Stochastic models of gene and species trees (VR//2010-5623)