CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Time to a single hybridization event in a group of species with unknown ancestral history

Krzysztof Bartoszek (Institutionen för matematiska vetenskaper) ; Graham Jones (Institutionen för biologi och miljövetenskap ; Institutionen för matematiska vetenskaper) ; Bengt Oxelman ; Serik Sagitov (Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik)
Journal of Theoretical Biology (0022-5193). Vol. 322 (2013), p. 1-6.
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

We consider a stochastic process for the generation of species which combines a Yule process with a simple model for hybridization between pairs of co-existent species. We assume that the origin of the process, when there was one species, occurred at an unknown time in the past, and we condition the process on producing n species via the Yule process and a single hybridization event. We prove results about the distribution of the time of the hybridization event. In particular we calculate a formula for all moments and show that under various conditions, the distribution tends to an exponential with rate twice that of the birth rate for the Yule process.

Nyckelord: Theoretical phylogenetics, Yule tree, Polyploidy, Uncertainty in phylogeny



Denna post skapades 2013-02-04. Senast ändrad 2016-07-11.
CPL Pubid: 172851

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för matematiska vetenskaperInstitutionen för matematiska vetenskaper (GU)
Institutionen för biologi och miljövetenskap (GU)
Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik (2005-2016)

Ämnesområden

Biologisk systematik

Chalmers infrastruktur

 


Projekt

Denna publikation är ett resultat av följande projekt:


Stochastic models of gene and species trees (VR//2010-5623)