CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Bottom-up derivation of an effective thermostat for united atoms simulations of water

Anders Eriksson ; Martin Nilsson Jacobi (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori) ; Johan Nyström (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori) ; Kolbjörn Tunström (Institutionen för energi och miljö)
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS (0021-9606). Vol. 130 (2009), 16,
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

In this article we derive the effective pairwise interactions in a Langevin-type united atoms model of water. The interactions are determined from the trajectories of a detailed molecular dynamics simulation of simple point charge water. A standard method is used for estimating the conservative interaction, whereas a new "bottom-up" method is used to determine the effective dissipative and stochastic interactions. We demonstrate that when compared to the standard united atoms model, the transport properties of the coarse-grained model is significantly improved by the introduction of the derived dissipative and stochastic interactions. The results are compared to a previous study, where a "top-down" approach was used to obtain transport properties consistent with those of the simple point charge water model. © 2009 American Institute of Physics.

Nyckelord: dissipative particle dynamics, molecular-dynamics, potentials, systems



Denna post skapades 2010-08-20. Senast ändrad 2016-06-29.
CPL Pubid: 124939

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för fysik (GU) (GU)
Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori
Institutionen för energi och miljö

Ämnesområden

Atom- och molekylfysik och optik

Chalmers infrastruktur