CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

Bottom-up derivation of an effective thermostat for united atoms simulations of water

Anders Eriksson ; Martin Nilsson Jacobi (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori) ; Johan Nyström (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori) ; Kolbjörn Tunström (Institutionen för energi och miljö)
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS (0021-9606). Vol. 130 (2009), 16,
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

In this article we derive the effective pairwise interactions in a Langevin-type united atoms model of water. The interactions are determined from the trajectories of a detailed molecular dynamics simulation of simple point charge water. A standard method is used for estimating the conservative interaction, whereas a new "bottom-up" method is used to determine the effective dissipative and stochastic interactions. We demonstrate that when compared to the standard united atoms model, the transport properties of the coarse-grained model is significantly improved by the introduction of the derived dissipative and stochastic interactions. The results are compared to a previous study, where a "top-down" approach was used to obtain transport properties consistent with those of the simple point charge water model. © 2009 American Institute of Physics.

Nyckelord: dissipative particle dynamics, molecular-dynamics, potentials, systems



Denna post skapades 2010-08-20. Senast ändrad 2016-06-29.
CPL Pubid: 124939

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för fysik (GU) (GU)
Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori (2005-2017)
Institutionen för energi och miljö (2005-2017)

Ämnesområden

Atom- och molekylfysik och optik

Chalmers infrastruktur