CPL - Chalmers Publication Library
| Utbildning | Forskning | Styrkeområden | Om Chalmers | In English In English Ej inloggad.

The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: A community effort

J. R. Wortman ; J. M. Gilsenan ; V. Joardar ; J. Deegan ; J. Clutterbuck ; M. R. Andersen ; D. Archer ; M. Bencina ; G. Braus ; P. Coutinho ; H. von Dohren ; J. Doonan ; A. J. M. Driessen ; P. Durek ; E. Espeso ; E. Fekete ; M. Flipphi ; C. G. Estrada ; S. Geysens ; G. Goldman ; P. W. J. de Groot ; K. Hansen ; S. D. Harris ; T. Heinekamp ; K. Helmstaedt ; B. Henrissat ; G. Hofmann ; T. Homan ; T. Horio ; H. Horiuchi ; S. James ; M. Jones ; L. Karaffa ; Z. Karanyi ; M. Kato ; N. Keller ; D. E. Kelly ; Jakw Kiel ; J. M. Kim ; I. J. van der Klei ; F. M. Klis ; A. Kovalchuk ; N. Krasevec ; C. P. Kubicek ; B. Liu ; A. MacCabe ; V. Meyer ; P. Mirabito ; M. Miskei ; M. Mos ; J. Mullins ; D. R. Nelson ; Jens B. Nielsen (Institutionen för kemi- och bioteknik, Systembiologi) ; B. R. Oakley ; S. A. Osmani ; T. Pakula ; A. Paszewski ; I. Paulsen ; S. Pilsyk ; I. Pocsi ; P. J. Punt ; A. F. J. Ram ; Q. H. Ren ; X. Robellet ; G. Robson ; B. Seiboth ; P. van Solingen ; T. Specht ; J. B. Sun ; N. Taheri-Talesh ; N. Takeshita ; D. Ussery ; P. A. vanKuyk ; H. Visser ; Pjiv de Vondervoort ; R. P. de Vries ; J. Walton ; X. Xiang ; Y. Xiong ; A. P. Zeng ; B. W. Brandt ; M. J. Cornell ; Camjj van den Hondel ; J. Visser ; S. G. Oliver ; G. Turner
Fungal Genetics and Biology (1087-1845). Vol. 46 (2009), p. S2-S13.
[Artikel, refereegranskad vetenskaplig]

The identification and annotation of protein-coding genes is one of the primary goals of whole-genome sequencing projects, and the accuracy of predicting the primary protein products of gene expression is vital to the interpretation of the available data and the design of downstream functional applications. Nevertheless, the comprehensive annotation of eukaryotic genomes remains a considerable challenge. Many genomes submitted to public databases, including those of major model organisms, contain significant numbers of wrong and incomplete gene predictions. We present a community-based reannotation of the Aspergillus nidulans genome with the primary goal of increasing the number and quality of protein functional assignments through the careful review of experts in the field of fungal biology. (C) 2009 Elsevier Inc. All rights reserved.

Nyckelord: Aspergillus nidulans, Aspergilli, Genome, Annotation, Fungal community, Assembly, Transcription factors, CADRE, gene-cluster, transcriptional activator, cell-wall, a-fumigatus, prediction, sequence, niger, dna, identification, biosynthesis



Den här publikationen ingår i följande styrkeområden:

Läs mer om Chalmers styrkeområden  

Denna post skapades 2010-02-25. Senast ändrad 2014-10-27.
CPL Pubid: 115141

 

Läs direkt!


Länk till annan sajt (kan kräva inloggning)


Institutioner (Chalmers)

Institutionen för kemi- och bioteknik, Systembiologi (2008-2014)

Ämnesområden

Livsvetenskaper
Dermatologi och venereologi

Chalmers infrastruktur